Сигма, лидер армии Маверика, была разрушена, когда он недооценил своего противника: одинокого воина, пробужденного в то время, которое он никогда не знал ... x. Прошло 6 месяцев, и X поднялся до звания лидера Maverick Hunters. Его первой задачей было исключить последний из Мавериков. Но когда он начал свое задание, таинственная группа репроизводств, называющих себя, появились Хантерс Хантерс с посланием X: остатки его падшего товарища, ноль, находились в руках охотников на X, и они планировали воскресить ноль сражаться вместе с ними и за их падшего лидера, Сигма. X теперь должен остановить x-охотники и спасение нуля и еще раз предотвратить восстание Sigma в конечную власть.
Sigma, the leader of the Maverick army, was destroyed when he underestimated his opponent: a lone warrior, awakened into a time he never knew...X. 6 months had passed, and X rose to the rank of leader of the Maverick Hunters. His first task was to eliminate the last of the Mavericks. But as he began his assignment, a mysterious group of Reploids calling themselves the X-Hunters appeared with a message to X: the remains of his fallen comrade, Zero, were in the hands of the X-Hunters, and they planned on resurrecting Zero to fight alongside them and for their fallen leader, Sigma. X must now stop the X-Hunters and rescue Zero, and once again prevent Sigma from rising back into ultimate power.